MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC plasmid pRKC30SC1

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015213	TGAT	2	8	748	755	25 %	50 %	25 %	0 %	325955699
2	NC_015213	GAT	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955699
3	NC_015213	CTG	2	6	982	987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955699
4	NC_015213	TTAA	2	8	1041	1048	50 %	50 %	0 %	0 %	325955699
5	NC_015213	CAA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955699
6	NC_015213	TACA	2	8	1094	1101	50 %	25 %	0 %	25 %	325955699
7	NC_015213	GAAT	2	8	1120	1127	50 %	25 %	25 %	0 %	325955699
8	NC_015213	CAA	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955699
9	NC_015213	ATCC	2	8	1185	1192	25 %	25 %	0 %	50 %	325955699
10	NC_015213	AAC	2	6	1193	1198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955699
11	NC_015213	ATT	2	6	1345	1350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955700
12	NC_015213	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325955700
13	NC_015213	ATA	2	6	1363	1368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955700
14	NC_015213	TGA	2	6	1446	1451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955700
15	NC_015213	TA	3	6	1513	1518	50 %	50 %	0 %	0 %	325955700
16	NC_015213	TTA	2	6	1564	1569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955700
17	NC_015213	CTT	2	6	1699	1704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955700
18	NC_015213	CAA	2	6	1705	1710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955700
19	NC_015213	AGAT	2	8	1713	1720	50 %	25 %	25 %	0 %	325955700
20	NC_015213	T	6	6	1748	1753	0 %	100 %	0 %	0 %	325955700
21	NC_015213	AAT	2	6	1754	1759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955700
22	NC_015213	TG	3	6	1761	1766	0 %	50 %	50 %	0 %	325955700
23	NC_015213	CAA	2	6	1789	1794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955700
24	NC_015213	TGTT	2	8	1806	1813	0 %	75 %	25 %	0 %	325955700
25	NC_015213	TCG	2	6	1948	1953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955700
26	NC_015213	TAT	2	6	2018	2023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955700
27	NC_015213	TATT	2	8	2205	2212	25 %	75 %	0 %	0 %	325955701
28	NC_015213	T	6	6	3081	3086	0 %	100 %	0 %	0 %	325955702
29	NC_015213	ATT	3	9	3268	3276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955702
30	NC_015213	ATCT	2	8	3279	3286	25 %	50 %	0 %	25 %	325955702
31	NC_015213	GAA	2	6	3423	3428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955703
32	NC_015213	TGT	2	6	3438	3443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955703
33	NC_015213	ACTC	2	8	3453	3460	25 %	25 %	0 %	50 %	325955703
34	NC_015213	GAATG	2	10	3675	3684	40 %	20 %	40 %	0 %	325955703
35	NC_015213	GTCC	2	8	3906	3913	0 %	25 %	25 %	50 %	325955703
36	NC_015213	ACT	2	6	3925	3930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955703
37	NC_015213	TAA	2	6	4001	4006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955703
38	NC_015213	TTG	2	6	4068	4073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955703
39	NC_015213	ATG	2	6	4145	4150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955703
40	NC_015213	A	6	6	4210	4215	100 %	0 %	0 %	0 %	325955703
41	NC_015213	AGT	2	6	4344	4349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955703
42	NC_015213	T	7	7	4372	4378	0 %	100 %	0 %	0 %	325955703
43	NC_015213	CGCC	2	8	4388	4395	0 %	0 %	25 %	75 %	325955703
44	NC_015213	TTG	2	6	4464	4469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955703

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.